La série reprend quatre ans après les événements de Terminator 2 : Le Jugement dernier, avec John et Sarah Connor essayant de rester sous le radar du gouvernement, alors qu'ils complotent pour détruire le réseau informatique, Skynet, dans l'espoir d'empêcher l'Armageddon.

Sarah Connor et son fils John se retrouvent seuls dans un monde hostile et complexe, après être venus à bout du Terminator. Ils fuient la loi et doivent combattre des ennemis en provenance du présent comme du futur. Sarah décide alors qu'il est temps de cesser de courir et d'affronter ses assaillants de face.